間違えて希望の農作物とは違う種を植えてしまったら?

これは意外とあるのではないでしょうか?

種まき機をトラクターに装着して、ぼんやりと位置をセットし、作業者を雇ったら、前に植えた作物をそのまま植え始めてしまった。

という時の対処法ですが。

上から耕してしまえばオッケー

上から耕してしまいましょう。

これで問題ありません。

肥料を撒いてしまっていたなら、肥料はそのまま残ります

肥料を撒いてしまった後でも問題ありません。

収穫しなかった場合の肥料というのは、そのまま残ります。